42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04790 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  100 
 
 		 405 aa  839    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  59.94 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  57.01 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  49.29 
 
 		 353 aa  330  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  51.63 
 
 		 248 aa  269  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  32.94 
 
 		 262 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  34.58 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  31.45 
 
 		 255 aa  126  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  33.06 
 
 		 249 aa  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  31.05 
 
 		 250 aa  119  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  35.83 
 
 		 249 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  29.48 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  32 
 
 		 254 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  31.05 
 
 		 249 aa  107  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  31.07 
 
 		 255 aa  106  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  29.08 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  26.78 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  32.47 
 
 		 351 aa  99.8  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.85819 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  31.75 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  28.44 
 
 		 274 aa  95.5  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  28.57 
 
 		 276 aa  93.2  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  28.25 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  29.78 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  27.43 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  24.23 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  25.62 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  30.94 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  30.39 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0755  translation initiation factor aIF-2  25.93 
 
 		 599 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1312  translation initiation factor IF-2  26.22 
 
 		 604 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.662538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  29.6 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03571  putative septum site-determining protein MinD  27.87 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.377857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2679  translation initiation factor IF-2  24.39 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  30.4 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  30.4 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2715  translation initiation factor aIF-2  25.3 
 
 		 607 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0223  translation initiation factor IF-2  29.05 
 
 		 591 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0201203  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1236  translation initiation factor IF-2  26.71 
 
 		 601 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0135157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3384  translation initiation factor IF-2  29.25 
 
 		 591 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000114381  normal  0.0283403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  28.69 
 
 		 489 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  27.81 
 
 		 496 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2060  translation initiation factor IF-2  24.2 
 
 		 597 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280189  normal  0.136093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>