More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17061 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  80.69 
 
 
485 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0853  signal recognition particle protein  99.38 
 
 
487 aa  959    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14711  signal recognition particle protein (SRP54)  76.85 
 
 
492 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.657856  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1517  Signal recognition particle protein  78.24 
 
 
492 aa  677    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.19 
 
 
492 aa  687    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1382  signal recognition particle protein  76.39 
 
 
489 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14471  signal recognition particle protein (SRP54)  76.85 
 
 
492 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17061  signal recognition particle protein (SRP54)  100 
 
 
487 aa  966    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254575  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14851  signal recognition particle protein (SRP54)  76.62 
 
 
498 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  77.21 
 
 
494 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.44 
 
 
490 aa  606  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  65.05 
 
 
485 aa  588  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.35 
 
 
483 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  65.01 
 
 
492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  65.01 
 
 
492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  63.64 
 
 
488 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  64.57 
 
 
489 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  66.75 
 
 
496 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  45.59 
 
 
479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  52.86 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  47.56 
 
 
521 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  51.07 
 
 
446 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  49.54 
 
 
443 aa  437  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  50.23 
 
 
449 aa  432  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  50 
 
 
449 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  47.4 
 
 
492 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  50 
 
 
449 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  50 
 
 
449 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  50 
 
 
449 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  50 
 
 
449 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  50 
 
 
449 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
449 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.22 
 
 
452 aa  426  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
449 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
449 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.03 
 
 
507 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1561  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.86 
 
 
491 aa  426  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0915  signal recognition particle  47.82 
 
 
520 aa  428  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00279212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  49.77 
 
 
449 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  46.52 
 
 
449 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  48.97 
 
 
450 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39979  IISP family transporter: signal recognition particle protein (SRP54)  51.03 
 
 
498 aa  422  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  47.22 
 
 
455 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1862  signal recognition particle protein  48.96 
 
 
444 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000295764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  48.51 
 
 
444 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.06 
 
 
512 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35185  predicted protein  51.77 
 
 
448 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  48.11 
 
 
449 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  45.47 
 
 
508 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  47.45 
 
 
455 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  49.19 
 
 
453 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  49.28 
 
 
446 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.32 
 
 
481 aa  419  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2026  signal recognition particle protein  48.47 
 
 
493 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000241588  hitchhiker  0.00894206 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  47.45 
 
 
455 aa  419  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  48.55 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  48.51 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  48.23 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  47.58 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  50.24 
 
 
435 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.07 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  45.64 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  47.92 
 
 
446 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  45.81 
 
 
458 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  45.81 
 
 
458 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  48.03 
 
 
458 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  49.2 
 
 
433 aa  412  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  46.6 
 
 
512 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.03 
 
 
443 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  48.03 
 
 
458 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  48.97 
 
 
433 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  46.5 
 
 
441 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2373  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  48.78 
 
 
447 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.377557 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  46.78 
 
 
450 aa  412  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  49.53 
 
 
453 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  47.8 
 
 
443 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2996  signal recognition particle protein  48.33 
 
 
454 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000641047  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3038  signal recognition particle protein  48.33 
 
 
454 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000193458  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  47.48 
 
 
453 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000605639  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  48.89 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  46.42 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  46.64 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  46.17 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  46.79 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  49.01 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000211534  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  49.06 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000003333  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  49.08 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  46.79 
 
 
448 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0655  signal recognition particle protein  49.31 
 
 
452 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000216081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  48.83 
 
 
453 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  48.73 
 
 
444 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  48.04 
 
 
442 aa  402  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>