28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1171 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1171  protein of unknown function ATP binding protein  100 
 
 
255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0042  GTPase  40.8 
 
 
252 aa  193  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2017  protein of unknown function ATP binding protein  42.97 
 
 
255 aa  185  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.112219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1791  GTPase  42.17 
 
 
254 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0371  GTPase  34.13 
 
 
262 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1730  GTPase  36 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1747  GTPase  33.2 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217761  hitchhiker  0.00298342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0577  GTPase  34.8 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00357734 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1567  GTPase  33.6 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0368  GTPase  36.14 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1948  GTPase  30.74 
 
 
260 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0409732  hitchhiker  0.00000000000000544697 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0585  GTPase  30.86 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04790  aerobic respiration-related protein, putative  31.07 
 
 
405 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.850973  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04680  ATP(GTP)-binding protein Fet5, putative  33.14 
 
 
287 aa  102  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379091  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12510  predicted protein  32.02 
 
 
276 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329335  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61200  predicted protein  28.71 
 
 
378 aa  101  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.594248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119578  XPA (DNA repair protein)-binding GTPase-like protein  32.94 
 
 
248 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00511386  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68965  putative transcription factor Fet5  33.71 
 
 
274 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.322101  normal  0.380866 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05536  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11820)  27.59 
 
 
396 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000293672  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46516  predicted protein  31.67 
 
 
351 aa  99.4  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.85819 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02438  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10630)  32.35 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.636847 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01223  ATP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10640)  31.89 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0439392 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6392  predicted protein  27.59 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02160  cytoplasm protein, putative  33.33 
 
 
360 aa  94  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_31068  predicted protein  26.67 
 
 
353 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20034  predicted protein  29.7 
 
 
306 aa  82.4  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12963  predicted protein  29.69 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0050441  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13119  predicted protein  29.3 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>