279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0397 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0397  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
748 aa  1488    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0559685  normal  0.676947 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.94 
 
 
743 aa  653    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1280  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  68.19 
 
 
746 aa  994    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.565285  normal  0.208692 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  83.82 
 
 
748 aa  1280    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000537624  normal  0.132965 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1564  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  55.72 
 
 
745 aa  738    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.08 
 
 
755 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.08 
 
 
766 aa  496  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  38.01 
 
 
767 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.56 
 
 
775 aa  457  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.12 
 
 
769 aa  452  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1139  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.2 
 
 
769 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.385051  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1536  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.36 
 
 
769 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18165  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  39.76 
 
 
760 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  34.8 
 
 
776 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  34.8 
 
 
776 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.37 
 
 
789 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1477  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.5 
 
 
795 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  34.8 
 
 
776 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.24 
 
 
766 aa  426  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.42 
 
 
778 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.74 
 
 
741 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.95 
 
 
762 aa  425  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.76 
 
 
763 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.95 
 
 
756 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.01 
 
 
776 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  39.76 
 
 
763 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.78 
 
 
776 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35 
 
 
751 aa  419  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.3 
 
 
775 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.73 
 
 
800 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.21 
 
 
740 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.9 
 
 
778 aa  413  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.65 
 
 
763 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.39 
 
 
758 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0181  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.14 
 
 
750 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.542448  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.82 
 
 
780 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.9 
 
 
785 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
763 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  34.89 
 
 
763 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.22 
 
 
739 aa  409  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.74 
 
 
767 aa  406  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.96 
 
 
784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.33 
 
 
770 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  33.9 
 
 
741 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  34.52 
 
 
741 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.1 
 
 
773 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.62 
 
 
773 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
773 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0417  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.95 
 
 
735 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2035  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.42 
 
 
775 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.68 
 
 
790 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.35 
 
 
773 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.63 
 
 
779 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.12 
 
 
752 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.92 
 
 
785 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 
749 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  33.64 
 
 
742 aa  397  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.62 
 
 
767 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.14 
 
 
745 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.9 
 
 
773 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.76 
 
 
752 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.77 
 
 
783 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.98 
 
 
763 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.15 
 
 
773 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.45 
 
 
744 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.93 
 
 
781 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.04 
 
 
780 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.51 
 
 
757 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  34.7 
 
 
786 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.65 
 
 
783 aa  392  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.63 
 
 
781 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  35.96 
 
 
771 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.02 
 
 
764 aa  392  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.65 
 
 
773 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.9 
 
 
774 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.59 
 
 
801 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.62 
 
 
764 aa  389  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  32.98 
 
 
741 aa  383  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.93 
 
 
785 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 
762 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.45 
 
 
780 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1577  hypothetical protein  36.83 
 
 
742 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.09 
 
 
753 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.9 
 
 
775 aa  382  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.04 
 
 
840 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.09 
 
 
835 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.84 
 
 
792 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.21 
 
 
837 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.04 
 
 
769 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.91 
 
 
773 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.04 
 
 
838 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  33.17 
 
 
808 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0391  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.29 
 
 
736 aa  376  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000910038  hitchhiker  0.000000117936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2500  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.46 
 
 
741 aa  378  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00852804  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.57 
 
 
766 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.9 
 
 
781 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.84 
 
 
818 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.63 
 
 
840 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.21 
 
 
785 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.8 
 
 
781 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>