More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0318 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
755 aa  1525    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.47 
 
 
748 aa  646    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000537624  normal  0.132965 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.66 
 
 
743 aa  634  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1280  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.34 
 
 
746 aa  631  1e-179  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.565285  normal  0.208692 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0397  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.94 
 
 
748 aa  626  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0559685  normal  0.676947 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.65 
 
 
766 aa  622  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1564  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.31 
 
 
745 aa  621  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.92 
 
 
769 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  39.72 
 
 
767 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1139  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.73 
 
 
769 aa  510  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.385051  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1536  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.17 
 
 
769 aa  502  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18165  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.92 
 
 
766 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.98 
 
 
741 aa  496  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.77 
 
 
785 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.84 
 
 
767 aa  491  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.31 
 
 
773 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.92 
 
 
778 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0181  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.34 
 
 
750 aa  484  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.542448  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  40.23 
 
 
760 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  37.97 
 
 
763 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.39 
 
 
775 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.28 
 
 
762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.08 
 
 
740 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.27 
 
 
763 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.27 
 
 
778 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.94 
 
 
773 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
776 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.23 
 
 
790 aa  472  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
776 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
776 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.71 
 
 
770 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.45 
 
 
773 aa  463  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  37.71 
 
 
763 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.26 
 
 
773 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.11 
 
 
756 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  38.5 
 
 
763 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  41.7 
 
 
786 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1577  hypothetical protein  38.04 
 
 
742 aa  457  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.72 
 
 
775 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.38 
 
 
766 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2500  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.04 
 
 
741 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00852804  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.71 
 
 
751 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0417  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.42 
 
 
735 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.11 
 
 
781 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.6 
 
 
780 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.6 
 
 
785 aa  452  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.95 
 
 
740 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.39 
 
 
758 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.26 
 
 
784 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.94 
 
 
776 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1477  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.22 
 
 
795 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.74 
 
 
764 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.22 
 
 
769 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  37.12 
 
 
739 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.69 
 
 
789 aa  446  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.9 
 
 
780 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.7 
 
 
767 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.66 
 
 
740 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.44 
 
 
785 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.8 
 
 
785 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.03 
 
 
774 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 
776 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.32 
 
 
752 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.82 
 
 
752 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.33 
 
 
781 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.1 
 
 
783 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  38.5 
 
 
763 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.6 
 
 
745 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.61 
 
 
766 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.86 
 
 
762 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.5 
 
 
792 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.98 
 
 
741 aa  436  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.7 
 
 
780 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.16 
 
 
773 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  36.58 
 
 
749 aa  432  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.91 
 
 
781 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.8 
 
 
770 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.92 
 
 
773 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.68 
 
 
775 aa  427  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.37 
 
 
764 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.37 
 
 
757 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.91 
 
 
818 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.83 
 
 
736 aa  423  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.05 
 
 
816 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.23 
 
 
778 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  38.16 
 
 
812 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.26 
 
 
779 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.06 
 
 
773 aa  426  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  34.82 
 
 
771 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.82 
 
 
753 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  35.27 
 
 
742 aa  419  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.97 
 
 
781 aa  422  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.29 
 
 
773 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
744 aa  422  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  37.52 
 
 
824 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.98 
 
 
758 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.07 
 
 
763 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.68 
 
 
849 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1090  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.42 
 
 
755 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.79 
 
 
758 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>