299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0207 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1564  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  54.12 
 
 
745 aa  727    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.21 
 
 
743 aa  670    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0397  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  83.82 
 
 
748 aa  1272    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0559685  normal  0.676947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1280  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  67.11 
 
 
746 aa  1003    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.565285  normal  0.208692 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
748 aa  1514    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000537624  normal  0.132965 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  49.6 
 
 
755 aa  630  1e-179  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.47 
 
 
766 aa  503  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.21 
 
 
769 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.67 
 
 
775 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1139  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.4 
 
 
769 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.385051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  36.35 
 
 
767 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1536  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.05 
 
 
769 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.52 
 
 
789 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.34 
 
 
778 aa  429  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.96 
 
 
766 aa  428  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.18 
 
 
773 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  34.5 
 
 
776 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  37.92 
 
 
763 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  37.24 
 
 
760 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  34.5 
 
 
776 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  34.5 
 
 
776 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.57 
 
 
751 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  37.78 
 
 
763 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.32 
 
 
758 aa  422  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.42 
 
 
763 aa  421  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1477  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.92 
 
 
795 aa  421  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.3 
 
 
741 aa  419  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.41 
 
 
776 aa  419  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0181  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.77 
 
 
750 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.542448  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.14 
 
 
778 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.24 
 
 
773 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.95 
 
 
773 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.66 
 
 
756 aa  416  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.88 
 
 
762 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.64 
 
 
767 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  34.52 
 
 
763 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.29 
 
 
776 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2035  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.16 
 
 
775 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0417  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.75 
 
 
735 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.26 
 
 
740 aa  405  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  34.61 
 
 
741 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.67 
 
 
783 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.12 
 
 
785 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.37 
 
 
780 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.42 
 
 
773 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.07 
 
 
770 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.45 
 
 
764 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.41 
 
 
779 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.81 
 
 
783 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.01 
 
 
773 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.78 
 
 
780 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  33.68 
 
 
763 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.29 
 
 
800 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.75 
 
 
775 aa  402  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.42 
 
 
785 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.63 
 
 
773 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.28 
 
 
784 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.18 
 
 
773 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.03 
 
 
774 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  33.73 
 
 
741 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  34.34 
 
 
749 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.9 
 
 
773 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.3 
 
 
763 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.01 
 
 
739 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.77 
 
 
780 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.74 
 
 
752 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.78 
 
 
781 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.54 
 
 
764 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.08 
 
 
752 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1577  hypothetical protein  36.4 
 
 
742 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.78 
 
 
753 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.17 
 
 
767 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.43 
 
 
790 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.45 
 
 
775 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  34.43 
 
 
742 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.74 
 
 
757 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.76 
 
 
781 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.09 
 
 
745 aa  386  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.17 
 
 
781 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.2 
 
 
758 aa  386  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  34.41 
 
 
771 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.28 
 
 
816 aa  382  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.51 
 
 
785 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.52 
 
 
779 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.62 
 
 
744 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2500  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.07 
 
 
741 aa  377  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00852804  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.4 
 
 
769 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.68 
 
 
766 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0391  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.5 
 
 
736 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000910038  hitchhiker  0.000000117936 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  32.92 
 
 
808 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  37.6 
 
 
786 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.63 
 
 
849 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.09 
 
 
835 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.96 
 
 
837 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.62 
 
 
740 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.81 
 
 
778 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.37 
 
 
840 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2093  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.96 
 
 
801 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.76 
 
 
792 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.16 
 
 
766 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>