227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0417 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  67.34 
 
 
740 aa  1001    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0181  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  63.26 
 
 
750 aa  917    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.542448  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2500  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  60.49 
 
 
741 aa  904    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00852804  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1577  hypothetical protein  58.7 
 
 
742 aa  847    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655573 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0417  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
735 aa  1492    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.52 
 
 
766 aa  558  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1139  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.85 
 
 
769 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.385051  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  42.29 
 
 
767 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.37 
 
 
769 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.47 
 
 
775 aa  535  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.66 
 
 
766 aa  538  1e-151  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1536  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.79 
 
 
769 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18165  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1477  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.31 
 
 
795 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.2 
 
 
763 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.23 
 
 
763 aa  459  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  38.65 
 
 
763 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  37.58 
 
 
749 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.19 
 
 
756 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.25 
 
 
777 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.12 
 
 
741 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.63 
 
 
766 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.48 
 
 
778 aa  438  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.16 
 
 
755 aa  438  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.16 
 
 
792 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38 
 
 
743 aa  434  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  37.63 
 
 
763 aa  432  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.01 
 
 
780 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  36.72 
 
 
760 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.34 
 
 
767 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.33 
 
 
762 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.47 
 
 
770 aa  429  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.15 
 
 
773 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  34.21 
 
 
776 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  37.42 
 
 
763 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  34.21 
 
 
776 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.19 
 
 
789 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.05 
 
 
767 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  33.95 
 
 
776 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.82 
 
 
758 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.04 
 
 
785 aa  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.67 
 
 
757 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1280  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.01 
 
 
746 aa  421  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.565285  normal  0.208692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.11 
 
 
758 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  33.42 
 
 
742 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.1 
 
 
785 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.99 
 
 
740 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.04 
 
 
790 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.26 
 
 
758 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.88 
 
 
781 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.6 
 
 
852 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  33.91 
 
 
741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.03 
 
 
764 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.65 
 
 
758 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.35 
 
 
785 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.86 
 
 
773 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  36.62 
 
 
758 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  34.7 
 
 
786 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.19 
 
 
763 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.27 
 
 
818 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.66 
 
 
778 aa  399  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  33.38 
 
 
741 aa  398  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.17 
 
 
740 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.99 
 
 
773 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.16 
 
 
751 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0935  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  33.29 
 
 
741 aa  396  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.993147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.42 
 
 
783 aa  398  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.09 
 
 
736 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  36.86 
 
 
758 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.39 
 
 
779 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  32.46 
 
 
741 aa  391  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.72 
 
 
781 aa  392  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.75 
 
 
748 aa  392  1e-107  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000537624  normal  0.132965 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.04 
 
 
753 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0397  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.95 
 
 
748 aa  389  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0559685  normal  0.676947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2094  hydrogenase maturation protein HypF  33.13 
 
 
808 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.77 
 
 
776 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.23 
 
 
749 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.3 
 
 
752 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.89 
 
 
756 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.42 
 
 
784 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50470  hydrogenase maturation carbamoyltransferase, HypF  38.24 
 
 
768 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.597235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  36.04 
 
 
771 aa  386  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.34 
 
 
752 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.59 
 
 
781 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1090  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.1 
 
 
755 aa  382  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.85 
 
 
779 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.17 
 
 
840 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.85 
 
 
776 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.28 
 
 
745 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  32.41 
 
 
739 aa  382  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.88 
 
 
777 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.09 
 
 
837 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.42 
 
 
780 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2409  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  32.29 
 
 
840 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0878931  hitchhiker  0.000263976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.46 
 
 
780 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  31.97 
 
 
838 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.07 
 
 
978 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.85 
 
 
783 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.37 
 
 
773 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.6 
 
 
773 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>