More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2342 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2342  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 
766 aa  1521    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0812  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.53 
 
 
769 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1139  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.53 
 
 
769 aa  595  1e-168  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.385051  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1536  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.14 
 
 
769 aa  585  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.18165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  40.28 
 
 
767 aa  579  1e-164  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0181  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.52 
 
 
750 aa  579  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.542448  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.4 
 
 
775 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.23 
 
 
766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1477  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.44 
 
 
795 aa  560  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0417  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.52 
 
 
735 aa  558  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2246  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.19 
 
 
740 aa  546  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106897  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2500  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.47 
 
 
741 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00852804  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1577  hypothetical protein  41.83 
 
 
742 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00655573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0915  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.37 
 
 
743 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  36.62 
 
 
776 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  36.62 
 
 
776 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  36.88 
 
 
776 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.33 
 
 
762 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.98 
 
 
751 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.94 
 
 
756 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.97 
 
 
776 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  41.67 
 
 
760 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.6 
 
 
767 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.37 
 
 
780 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.57 
 
 
780 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.21 
 
 
792 aa  505  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.91 
 
 
758 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.22 
 
 
773 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.74 
 
 
770 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1903  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.82 
 
 
783 aa  499  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.25 
 
 
778 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  38.74 
 
 
749 aa  498  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.7 
 
 
783 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.66 
 
 
773 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.95 
 
 
777 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.65 
 
 
764 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.78 
 
 
758 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.37 
 
 
767 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.08 
 
 
741 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.05 
 
 
763 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 
763 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.9 
 
 
789 aa  489  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.87 
 
 
775 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  36.87 
 
 
763 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.59 
 
 
779 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.46 
 
 
778 aa  479  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.08 
 
 
744 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 
773 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39 
 
 
766 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.54 
 
 
785 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.97 
 
 
785 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.69 
 
 
781 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  36.28 
 
 
741 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  36.09 
 
 
786 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.54 
 
 
776 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.78 
 
 
774 aa  476  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1167  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.26 
 
 
757 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1898  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  35.74 
 
 
739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  36.36 
 
 
763 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.77 
 
 
781 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.85 
 
 
773 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0318  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.92 
 
 
755 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.25 
 
 
777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2028  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.04 
 
 
800 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.13 
 
 
752 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  33.29 
 
 
780 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  36.41 
 
 
741 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  38.71 
 
 
824 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.31 
 
 
816 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.01 
 
 
790 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.63 
 
 
773 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  36.54 
 
 
771 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.42 
 
 
752 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.77 
 
 
852 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.56 
 
 
758 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.88 
 
 
785 aa  465  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.36 
 
 
793 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.43 
 
 
978 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.47 
 
 
762 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.04 
 
 
781 aa  464  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.98 
 
 
740 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.29 
 
 
745 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.92 
 
 
758 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.68 
 
 
779 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.03 
 
 
785 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.78 
 
 
835 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386195  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  40.16 
 
 
758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.78 
 
 
818 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.63 
 
 
803 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1910  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.53 
 
 
838 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.402426  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  38.63 
 
 
803 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1917  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.16 
 
 
840 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.998639  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  40.77 
 
 
758 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1431  hydrogenase maturation protein HypF  33.42 
 
 
742 aa  451  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.26 
 
 
784 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1280  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.96 
 
 
746 aa  450  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.565285  normal  0.208692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1817  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  34.53 
 
 
836 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.35 
 
 
740 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1884  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  35.76 
 
 
837 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1175  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.72 
 
 
763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.311862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>