249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3734 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3734  OmpA/MotB  100 
 
 		 302 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0228295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 358 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  31.37 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  31.37 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  31.37 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  30 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 729 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0911  OmpA/MotB domain-containing protein  32.65 
 
 		 178 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.855995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  31.19 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  31.37 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  33.72 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  28.86 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  24.29 
 
 		 499 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 537 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1452  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  43.08 
 
 		 458 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.691281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  32.43 
 
 		 269 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  35.42 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1334  OmpA/MotB domain protein  31.63 
 
 		 178 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.471341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  30.39 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  33.03 
 
 		 269 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  30.28 
 
 		 222 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  28.99 
 
 		 637 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2372  OmpA/MotB domain protein  29.24 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0195446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  32.38 
 
 		 221 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  34.57 
 
 		 358 aa  52.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1745  OmpA domain-containing protein  26.61 
 
 		 524 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.155252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  34.58 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.65 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  29.09 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 487 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  27.52 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 727 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  30.28 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  31.19 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 361 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  31.13 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3509  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 412 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05164  hypothetical protein  39.73 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  40.38 
 
 		 517 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  28.97 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2141  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 520 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0276844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  35.78 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  30.61 
 
 		 586 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  28.97 
 
 		 226 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 813 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  28.44 
 
 		 331 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  34.12 
 
 		 207 aa  49.3  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 412 aa  48.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  32.71 
 
 		 498 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  32.41 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  39.24 
 
 		 201 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  29.91 
 
 		 190 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  32.98 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  30.39 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  31.52 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  31.52 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  29.89 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3487  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 		 522 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.662497  normal  0.283139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 367 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  32.11 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  30.56 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  32.38 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  35.62 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32.81 
 
 		 493 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  30.91 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>