More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2065 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 193 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  82.29 
 
 		 200 aa  270  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  73.17 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  70.41 
 
 		 170 aa  214  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  67.06 
 
 		 177 aa  205  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  72.44 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  78.21 
 
 		 176 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  61.02 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.2 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.5 
 
 		 330 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.53 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.6 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  66.46 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  64.1 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.94 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  58.96 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  68.18 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  56.74 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  56.74 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  58.56 
 
 		 208 aa  168  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  63.01 
 
 		 178 aa  168  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  65.19 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.99 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  64.94 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  64.38 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  64.63 
 
 		 172 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  57.72 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  57.72 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  57.72 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.28 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.74 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  58.06 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  57.79 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.59 
 
 		 193 aa  141  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.49 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.65 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  41.77 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.67 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.37 
 
 		 160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  34.52 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.21 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  41.46 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  58.17 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  33.97 
 
 		 164 aa  115  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.68 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  39.66 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.99 
 
 		 166 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  41.29 
 
 		 159 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 162 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.5 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  40.61 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.2 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.65 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.71 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.5 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.25 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  40.85 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.1 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.81 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.29 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  32.08 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  35.51 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  37.27 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  39.44 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  37.08 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  41.62 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  40.65 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.48 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  34.57 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  41.62 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  40.34 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.18 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  40.65 
 
 		 180 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  32.92 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  39.67 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  37.08 
 
 		 181 aa  101  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  37.5 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  39.63 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  45.12 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>