More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  100 
 
 		 208 aa  400  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  64.71 
 
 		 177 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.15 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  59.39 
 
 		 182 aa  174  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  58.18 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  55.81 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  60.65 
 
 		 189 aa  168  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.63 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  57.31 
 
 		 199 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  56.98 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.76 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.14 
 
 		 176 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  49.76 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  56.4 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.26 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  61.08 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  57.42 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.86 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.97 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.02 
 
 		 330 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  62.58 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 		 193 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  58.06 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.41 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.97 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  59.24 
 
 		 175 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.12 
 
 		 193 aa  142  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.43 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  55.83 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  54.42 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 156 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  41.45 
 
 		 161 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  58.97 
 
 		 178 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  55.62 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 194 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.85 
 
 		 188 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  54.45 
 
 		 211 aa  121  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.74 
 
 		 167 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 164 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.06 
 
 		 166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.22 
 
 		 164 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 162 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.5 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 163 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.67 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  35.67 
 
 		 157 aa  111  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.17 
 
 		 184 aa  111  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.16 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  32.89 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  33.54 
 
 		 157 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  35 
 
 		 157 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.29 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  30.91 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  41.07 
 
 		 183 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  34.84 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.01 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.82 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  35 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.79 
 
 		 163 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.48 
 
 		 172 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  35.58 
 
 		 158 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.77 
 
 		 164 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  42.31 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 180 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.92 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  37.72 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 168 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  44.17 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 168 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  31.21 
 
 		 184 aa  98.2  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 284 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 275 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.55 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.21 
 
 		 165 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.83 
 
 		 162 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  31.21 
 
 		 184 aa  97.1  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>