More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1345 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  100 
 
 		 178 aa  344  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.66 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  66.47 
 
 		 200 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  63.58 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.6 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.47 
 
 		 330 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  67.48 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  60.12 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  66.46 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.12 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.75 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  57.49 
 
 		 188 aa  160  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  62.03 
 
 		 189 aa  160  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.41 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  67.53 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.46 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.63 
 
 		 189 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.82 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.45 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  59.62 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  60.12 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  57.74 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.49 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  56.88 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  55.76 
 
 		 192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  55.76 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  56.25 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  55.83 
 
 		 208 aa  140  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.79 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.97 
 
 		 193 aa  134  8e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  60.65 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  57.82 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.52 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  50.97 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.27 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  35.19 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  35.57 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.94 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  35.06 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.24 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  55.84 
 
 		 211 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  41.42 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.65 
 
 		 167 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 161 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  40 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.24 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0992  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.45 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0391793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.48 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  36.26 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 165 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  39.88 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  42.17 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  39.26 
 
 		 168 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  42.17 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  29.94 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  31.61 
 
 		 181 aa  97.8  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.06 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  42.51 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  36.02 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  34.78 
 
 		 181 aa  95.5  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.61 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.06 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.91 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  35.4 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.94 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  42.5 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.2 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  35.4 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  29.11 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.74 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1009  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.47 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.03 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  30.38 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>