More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0426 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  93.37 
 
 
181 aa  347  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  80.66 
 
 
181 aa  304  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  80.66 
 
 
181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  80.11 
 
 
181 aa  302  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
180 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
180 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
180 aa  271  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
180 aa  271  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  75.14 
 
 
180 aa  270  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
275 aa  269  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  75.69 
 
 
284 aa  269  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  75.14 
 
 
180 aa  269  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  71.82 
 
 
180 aa  265  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 
180 aa  264  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  71.82 
 
 
180 aa  264  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 
180 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 
180 aa  263  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 
180 aa  263  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 
180 aa  262  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  71.74 
 
 
183 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  72.38 
 
 
180 aa  247  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  69.94 
 
 
183 aa  234  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  64.32 
 
 
180 aa  217  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  63.13 
 
 
182 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  62.98 
 
 
183 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  61.45 
 
 
184 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  60.33 
 
 
186 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  65.12 
 
 
182 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  59.78 
 
 
186 aa  210  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  66.67 
 
 
179 aa  208  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  66.87 
 
 
182 aa  206  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  61.67 
 
 
182 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  60 
 
 
182 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  58.89 
 
 
183 aa  201  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  64.71 
 
 
172 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  60.12 
 
 
182 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  62.18 
 
 
182 aa  190  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  62.78 
 
 
171 aa  182  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  61.84 
 
 
168 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  55.19 
 
 
164 aa  174  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  55.03 
 
 
173 aa  174  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  53.75 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.03 
 
 
173 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  53.41 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.46 
 
 
173 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  54.44 
 
 
173 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  51.19 
 
 
176 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  51.53 
 
 
164 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 
164 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  47.8 
 
 
194 aa  164  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.43 
 
 
133 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  47.25 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  54.32 
 
 
173 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  51.85 
 
 
173 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  53.18 
 
 
174 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 
173 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 
173 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  45.6 
 
 
194 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.32 
 
 
183 aa  155  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 
173 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  54.32 
 
 
173 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  52.9 
 
 
174 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  53.7 
 
 
173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  53.7 
 
 
173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.21 
 
 
176 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  53.7 
 
 
173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  53.7 
 
 
173 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  52.9 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 
165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  53.55 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 
175 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  53.09 
 
 
173 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  53.09 
 
 
173 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.66 
 
 
158 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  48.68 
 
 
180 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  52.47 
 
 
173 aa  148  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  53.09 
 
 
173 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 
182 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  50.82 
 
 
189 aa  147  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.17 
 
 
163 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.74 
 
 
164 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.42 
 
 
174 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
162 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  49.34 
 
 
168 aa  144  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  50 
 
 
173 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  49.12 
 
 
173 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48 
 
 
179 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  45.4 
 
 
165 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  52.9 
 
 
174 aa  142  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  52.26 
 
 
173 aa  141  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 
173 aa  140  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  52.26 
 
 
173 aa  140  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.13 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  49.12 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  54.07 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  48.31 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.278528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>