More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1075 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  100 
 
 
164 aa  331  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  92.68 
 
 
164 aa  312  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  73.29 
 
 
171 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  71.95 
 
 
164 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  70.73 
 
 
164 aa  239  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  74.51 
 
 
176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  68.75 
 
 
161 aa  225  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  70.7 
 
 
178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  60.26 
 
 
173 aa  184  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.49 
 
 
183 aa  183  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  57.62 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.94 
 
 
173 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.55 
 
 
163 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  54.55 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 
173 aa  177  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  59.21 
 
 
173 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  55.19 
 
 
181 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  53.9 
 
 
181 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  53.9 
 
 
181 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  53.46 
 
 
180 aa  174  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  55.84 
 
 
183 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 
183 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  56.95 
 
 
173 aa  174  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  54.61 
 
 
180 aa  174  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  53.46 
 
 
162 aa  173  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  53.37 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.26 
 
 
173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 
181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  53.75 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  53.12 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  53.12 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  52.87 
 
 
182 aa  170  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  52.5 
 
 
180 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.4 
 
 
165 aa  168  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
180 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
284 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
275 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  57.62 
 
 
174 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 
173 aa  167  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  51.88 
 
 
180 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.58 
 
 
176 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  58.67 
 
 
174 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 
173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 
173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  56.58 
 
 
175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  47.27 
 
 
166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  57.62 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  52.35 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  56.29 
 
 
173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  56.58 
 
 
173 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
173 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  54.25 
 
 
184 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  55.63 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 
165 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
174 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.65 
 
 
165 aa  157  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  56.29 
 
 
173 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 
172 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.63 
 
 
158 aa  156  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  54.9 
 
 
179 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  49.38 
 
 
182 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  51.59 
 
 
182 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  51.23 
 
 
168 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  53.64 
 
 
174 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
173 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  57.78 
 
 
173 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
173 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  57.78 
 
 
173 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
173 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
173 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  57.78 
 
 
173 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
173 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 
173 aa  153  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.09 
 
 
175 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  57.04 
 
 
173 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  55.63 
 
 
173 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  54.78 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>