More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1798 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.93 
 
 
165 aa  183  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.88 
 
 
167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  52.23 
 
 
162 aa  180  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  51.59 
 
 
166 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.63 
 
 
163 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  48.45 
 
 
182 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.53 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.44 
 
 
179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  49.07 
 
 
165 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.17 
 
 
160 aa  160  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 
159 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.05 
 
 
164 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.68 
 
 
162 aa  154  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 
164 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.68 
 
 
171 aa  149  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
157 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  44.72 
 
 
161 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  43.59 
 
 
156 aa  148  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
164 aa  146  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  49.69 
 
 
165 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 
158 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  44.1 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.99 
 
 
192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 
176 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.96 
 
 
172 aa  144  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 
171 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.67 
 
 
191 aa  140  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.4 
 
 
157 aa  140  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.24 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 
189 aa  139  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.67 
 
 
183 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.44 
 
 
200 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.7 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 
173 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.03 
 
 
173 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.36 
 
 
184 aa  137  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 
183 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
168 aa  137  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 
168 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  44.37 
 
 
173 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
180 aa  134  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.31 
 
 
167 aa  134  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 
181 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  45.91 
 
 
194 aa  134  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.74 
 
 
187 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  47.79 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 
200 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 
180 aa  133  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 
181 aa  133  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 
183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.06 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 
181 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
284 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 
194 aa  131  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 
175 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 
180 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 
182 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
275 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 
180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
163 aa  131  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.89 
 
 
166 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
157 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 
180 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 
180 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.48 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 
180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 
157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  44.65 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.33 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  46.32 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.32 
 
 
173 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 
189 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  46.32 
 
 
173 aa  128  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 
181 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  46.32 
 
 
173 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  46.32 
 
 
173 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 
180 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  46.32 
 
 
173 aa  128  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>