More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13940 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  100 
 
 		 197 aa  386  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  62.03 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.62 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.46 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.95 
 
 		 190 aa  184  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  54.59 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  55.15 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.16 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.75 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.9 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 		 192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  55 
 
 		 192 aa  171  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  56.38 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  58.97 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  58.44 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.33 
 
 		 176 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.42 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.24 
 
 		 330 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  54.14 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  49.27 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  60.51 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.5 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.18 
 
 		 176 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  61.15 
 
 		 172 aa  148  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  61.15 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  49.21 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.06 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  50.96 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  57.74 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  51.59 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 193 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.5 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  55 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  55.63 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.76 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.79 
 
 		 160 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.41 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  39.49 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 164 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.51 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.1 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.14 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 		 166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.03 
 
 		 163 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  39.35 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  40.33 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.22 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.26 
 
 		 179 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.85 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.52 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.32 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  37.97 
 
 		 159 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  31.79 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  35.21 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  39.57 
 
 		 165 aa  105  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  39.57 
 
 		 165 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 161 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  40.79 
 
 		 165 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.26 
 
 		 171 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  41.25 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  38.69 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.13 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  36.84 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.36 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.83 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.25 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.13 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  32.68 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.18 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  38.92 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  36.9 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  36.9 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.77 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>