More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0180 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  100 
 
 
162 aa  329  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  79.62 
 
 
166 aa  270  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  61.39 
 
 
182 aa  217  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  63.4 
 
 
159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.69 
 
 
179 aa  206  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.44 
 
 
163 aa  206  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.41 
 
 
165 aa  204  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  55.35 
 
 
165 aa  200  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.78 
 
 
164 aa  194  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  55.97 
 
 
164 aa  193  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
164 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  55.84 
 
 
164 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.24 
 
 
167 aa  184  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  55.19 
 
 
171 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  52.23 
 
 
161 aa  180  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.98 
 
 
160 aa  174  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  53.46 
 
 
164 aa  173  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  52.23 
 
 
164 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  56.49 
 
 
165 aa  167  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  50.96 
 
 
161 aa  167  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  51.25 
 
 
172 aa  167  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  55.84 
 
 
164 aa  166  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.87 
 
 
171 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  47.47 
 
 
176 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.32 
 
 
162 aa  163  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  53.55 
 
 
168 aa  161  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 
168 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.34 
 
 
164 aa  158  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
173 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 
164 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.19 
 
 
166 aa  152  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
158 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 
157 aa  151  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.35 
 
 
192 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.64 
 
 
184 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
180 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 
183 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
181 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
181 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
181 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 
182 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 
181 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.34 
 
 
167 aa  146  9e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.36 
 
 
200 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.12 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
181 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  43.62 
 
 
180 aa  144  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  43.95 
 
 
173 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 
163 aa  144  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.5 
 
 
173 aa  144  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.15 
 
 
165 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.54 
 
 
167 aa  143  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
173 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.22 
 
 
173 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  46.15 
 
 
165 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
180 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  41.51 
 
 
180 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  44.94 
 
 
172 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 
173 aa  140  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.99 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.97 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
180 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  41.51 
 
 
180 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 
182 aa  138  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 
180 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 
180 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  43.31 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 
168 aa  137  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  43.59 
 
 
182 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 
180 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 
182 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
194 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
194 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  43.23 
 
 
182 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 
275 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 
183 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  41.88 
 
 
186 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  42.31 
 
 
182 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  41.25 
 
 
186 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.38 
 
 
183 aa  136  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 
284 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  42.59 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
178 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  43.95 
 
 
173 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  44.17 
 
 
175 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  50 
 
 
165 aa  134  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.33 
 
 
176 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  39.62 
 
 
180 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  45.57 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>