More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0930 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 182 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  75.14 
 
 		 182 aa  275  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  72.97 
 
 		 186 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  72.43 
 
 		 186 aa  270  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 		 182 aa  268  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  70.56 
 
 		 182 aa  267  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  70.88 
 
 		 182 aa  264  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  70.88 
 
 		 182 aa  262  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  68.89 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  63.89 
 
 		 184 aa  227  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  62.01 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  58.89 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  58.89 
 
 		 181 aa  210  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  60.56 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  60.95 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  57.22 
 
 		 180 aa  200  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 		 180 aa  198  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 		 180 aa  197  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 275 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 284 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 180 aa  193  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  55 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  60.39 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  61.49 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  66.24 
 
 		 171 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  56.96 
 
 		 168 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  62.8 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  48 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  49.14 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.43 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  48.55 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 164 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.71 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  46.86 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  45.71 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  45.71 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  46.06 
 
 		 194 aa  144  8.000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  49.14 
 
 		 173 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.72 
 
 		 133 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  43.24 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  49.14 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  48.57 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  49.43 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  49.43 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.32 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  48 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  49.43 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  49.38 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  48.77 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  48.78 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  47.77 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.13 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  47.77 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  49.08 
 
 		 173 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  48.47 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  48 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  48.47 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  48.47 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  48.47 
 
 		 173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  46.52 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  48.47 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  48.47 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  49.04 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  48.41 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  46.86 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>