More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1720 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
166 aa  338  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 
157 aa  180  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  55.19 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.01 
 
 
165 aa  170  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.97 
 
 
179 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.27 
 
 
163 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  52 
 
 
166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.78 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.59 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  51.61 
 
 
164 aa  161  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
182 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  48 
 
 
161 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 
165 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  48.05 
 
 
171 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.33 
 
 
164 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 
156 aa  147  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
159 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
158 aa  147  9e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  56.13 
 
 
165 aa  145  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  56.13 
 
 
165 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  58.67 
 
 
163 aa  145  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  43.83 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
161 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
164 aa  144  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 
164 aa  141  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
157 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  48.32 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.37 
 
 
184 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 
176 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 
165 aa  137  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 
160 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 
183 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  44.65 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.89 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  46.58 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.32 
 
 
200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 
181 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.04 
 
 
192 aa  130  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  40.67 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.67 
 
 
167 aa  130  9e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.74 
 
 
157 aa  130  9e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 
157 aa  130  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.15 
 
 
165 aa  130  9e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44 
 
 
165 aa  128  3e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 
181 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 
180 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
168 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  44 
 
 
165 aa  127  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.58 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  43.24 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.57 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 
180 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 
172 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
275 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.07 
 
 
178 aa  124  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
168 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
180 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
180 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
180 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
180 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
180 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
284 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  37.87 
 
 
182 aa  124  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
182 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.33 
 
 
183 aa  124  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 
180 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  42.57 
 
 
157 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 
180 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 
173 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 
168 aa  120  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.36 
 
 
191 aa  121  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.75 
 
 
166 aa  120  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 
186 aa  120  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  38.27 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  40 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  42.22 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  41.48 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.22 
 
 
173 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  42.22 
 
 
173 aa  118  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  42.22 
 
 
173 aa  118  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  40 
 
 
174 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  42.96 
 
 
173 aa  118  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  36.09 
 
 
182 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>