More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1864 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  48.7 
 
 		 159 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  46.94 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.3 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.95 
 
 		 179 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  44.37 
 
 		 166 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.34 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.92 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.41 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 		 164 aa  134  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.18 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.03 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  46.72 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.93 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  42.57 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  44.2 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.02 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.78 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  44.2 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  44.2 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.11 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.07 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.18 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 158 aa  121  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.9 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44.9 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.76 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  41.3 
 
 		 157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.76 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  46.09 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  44.53 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.85 
 
 		 175 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.74 
 
 		 164 aa  115  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  44.53 
 
 		 165 aa  115  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  38.52 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3217  Holliday junction resolvase  35.94 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.571528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.13 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  45.32 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  35.94 
 
 		 169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  37.78 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  39.06 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  37.78 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  42.97 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.89 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  39.19 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  38.41 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  41.41 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.95 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  42.45 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.78 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  36.72 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.18 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  39.1 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.31 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  39.57 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  39.06 
 
 		 232 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1230  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  38.69 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.82 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  35.19 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.5 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0964  Holliday junction resolvase  39.06 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  32.81 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  40.82 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  39.06 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  34.34 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>