More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0657 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  100 
 
 
180 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  98.89 
 
 
180 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  98.89 
 
 
180 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  96.67 
 
 
180 aa  348  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  93.33 
 
 
180 aa  337  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  91.26 
 
 
183 aa  331  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  89.44 
 
 
180 aa  326  9e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
180 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
180 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
180 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
180 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
284 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  88.89 
 
 
275 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  88.33 
 
 
180 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  85.56 
 
 
180 aa  313  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  85 
 
 
180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  90.12 
 
 
183 aa  309  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  85 
 
 
180 aa  288  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 
181 aa  269  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  72.93 
 
 
181 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  72.93 
 
 
181 aa  267  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 
181 aa  262  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  70.17 
 
 
181 aa  256  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  61.08 
 
 
180 aa  214  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  65.43 
 
 
182 aa  211  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  62.01 
 
 
183 aa  208  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  62.35 
 
 
186 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  64.42 
 
 
182 aa  206  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  61.76 
 
 
186 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  65.43 
 
 
182 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  57.54 
 
 
184 aa  201  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  61.68 
 
 
182 aa  200  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  62.09 
 
 
172 aa  197  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  62.22 
 
 
179 aa  190  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  55 
 
 
182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  59.26 
 
 
182 aa  187  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  60.87 
 
 
183 aa  187  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  57.76 
 
 
168 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  59.49 
 
 
182 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  59.78 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  53.37 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  51.52 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  52.5 
 
 
164 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  49.17 
 
 
194 aa  169  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 
173 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  48.62 
 
 
194 aa  167  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.2 
 
 
173 aa  167  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  48.62 
 
 
194 aa  166  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  51.88 
 
 
164 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  53.14 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.31 
 
 
133 aa  164  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  56.58 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  53.37 
 
 
164 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  52.15 
 
 
171 aa  160  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  55.19 
 
 
164 aa  160  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.16 
 
 
165 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.86 
 
 
173 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  55.21 
 
 
173 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  52.91 
 
 
174 aa  158  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  54.04 
 
 
173 aa  158  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  54.04 
 
 
173 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  54.04 
 
 
173 aa  157  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 
173 aa  157  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  52.38 
 
 
173 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  55.97 
 
 
179 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  54.04 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  53.42 
 
 
173 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 
173 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  51.53 
 
 
173 aa  155  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.5 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  50.55 
 
 
189 aa  147  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  51.33 
 
 
180 aa  147  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  53.42 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  49.35 
 
 
174 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  50.63 
 
 
165 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  50.32 
 
 
175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  53.46 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.56 
 
 
175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 
164 aa  142  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.84 
 
 
163 aa  141  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.36 
 
 
176 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.68 
 
 
164 aa  140  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.3 
 
 
175 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  44.79 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  51.7 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.66 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52 
 
 
185 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 
174 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  55.48 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  55.48 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  55.48 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>