More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1109 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 159 aa  324  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  64.71 
 
 		 166 aa  217  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  63.4 
 
 		 162 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.09 
 
 		 165 aa  209  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.26 
 
 		 163 aa  209  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  62.18 
 
 		 165 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.04 
 
 		 167 aa  194  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  53.85 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  52.23 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.55 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.97 
 
 		 179 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.34 
 
 		 164 aa  170  9e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  57.52 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.64 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  47.06 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.29 
 
 		 164 aa  157  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  54.9 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 		 176 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.99 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  51.59 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.91 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  54 
 
 		 168 aa  143  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  54 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  48.68 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  46.3 
 
 		 180 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  54.9 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.7 
 
 		 178 aa  141  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.19 
 
 		 184 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  46.54 
 
 		 181 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.67 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.8 
 
 		 192 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 180 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  48.72 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  45.91 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 275 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 284 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.01 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.1 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  44.03 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  44.03 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 180 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  44.23 
 
 		 180 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.81 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.39 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.67 
 
 		 187 aa  133  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.71 
 
 		 173 aa  133  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 		 180 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.67 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.1 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  42.28 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.41 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.42 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  48.05 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  48.05 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  46.45 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.71 
 
 		 191 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.81 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  43.95 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.22 
 
 		 164 aa  127  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.44 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  44.94 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.03 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.1 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  44.23 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  45.03 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.03 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.56 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>