More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0503 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  95.58 
 
 		 181 aa  352  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  95.58 
 
 		 181 aa  351  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  80.66 
 
 		 181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  79.56 
 
 		 181 aa  303  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 		 180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 		 180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 		 180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 		 180 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  76.8 
 
 		 180 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 		 275 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  77.35 
 
 		 284 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  76.24 
 
 		 180 aa  277  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  74.59 
 
 		 180 aa  277  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 		 180 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 		 180 aa  270  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 		 180 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  72.93 
 
 		 180 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 		 180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 		 180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  73.37 
 
 		 183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  73.48 
 
 		 180 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  71.68 
 
 		 183 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  63.89 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  64.2 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  63.64 
 
 		 186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  62.01 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  68.71 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  65.12 
 
 		 182 aa  218  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  67.22 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  61.45 
 
 		 184 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  60.54 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  61.11 
 
 		 182 aa  210  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  58.89 
 
 		 183 aa  204  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  63.35 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  64.56 
 
 		 182 aa  200  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  63.19 
 
 		 182 aa  200  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  63.82 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.71 
 
 		 173 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 		 171 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.66 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  54.94 
 
 		 173 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  50.57 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  52.47 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  50.31 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  48.81 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  52.07 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  54.32 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  54.32 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  53.7 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  54.32 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  54.32 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.86 
 
 		 133 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  45.05 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  51.85 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  51.85 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  51.85 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  51.85 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  44.51 
 
 		 194 aa  157  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  53.09 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  51.85 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  50.62 
 
 		 173 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  50.62 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  43.41 
 
 		 194 aa  151  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  52.9 
 
 		 174 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  50.87 
 
 		 174 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  52.26 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  52.05 
 
 		 173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  52.9 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.75 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  51.92 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.58 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.98 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 162 aa  148  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  42.24 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  49.73 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  50.93 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.93 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  47.33 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.84 
 
 		 179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 		 173 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  51.46 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  49.72 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>