More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2336 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  100 
 
 
161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  68.75 
 
 
164 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  67.5 
 
 
164 aa  223  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  66.88 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  66.88 
 
 
164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  65.38 
 
 
176 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  66.25 
 
 
171 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.24 
 
 
183 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.82 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  64.1 
 
 
178 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  54.9 
 
 
173 aa  168  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  50.96 
 
 
162 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  57.62 
 
 
173 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 
181 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  56.58 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  54.78 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.33 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  53.5 
 
 
165 aa  161  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
180 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
180 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  55.92 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 
180 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 
180 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 
181 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  55.35 
 
 
186 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  55.56 
 
 
173 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56 
 
 
173 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  50.96 
 
 
182 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  54.72 
 
 
186 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
174 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.63 
 
 
165 aa  158  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  49.39 
 
 
194 aa  157  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
180 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
183 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 
180 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
284 aa  157  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
275 aa  157  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  49.39 
 
 
194 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  55.33 
 
 
173 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  53.95 
 
 
168 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  50.67 
 
 
180 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  54.9 
 
 
159 aa  154  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  54.49 
 
 
182 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.98 
 
 
176 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  55.26 
 
 
175 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  56.95 
 
 
173 aa  154  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  47.2 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  154  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  54 
 
 
173 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  56.95 
 
 
173 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  56.95 
 
 
173 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
174 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  54 
 
 
173 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  56.29 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
173 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
173 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
173 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
173 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  151  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  52 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  53.9 
 
 
182 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  52 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
173 aa  150  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  56 
 
 
173 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.29 
 
 
164 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  53.33 
 
 
174 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  44.72 
 
 
161 aa  148  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  49.38 
 
 
172 aa  148  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 
182 aa  148  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  50 
 
 
194 aa  147  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  53.33 
 
 
174 aa  147  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 
182 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  54.67 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>