More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2115 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.9 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  58.71 
 
 
165 aa  187  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.61 
 
 
163 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  50.64 
 
 
162 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  46.91 
 
 
182 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  48.67 
 
 
164 aa  169  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.96 
 
 
165 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  47.8 
 
 
166 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 
159 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54 
 
 
160 aa  162  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  49.36 
 
 
161 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  53.46 
 
 
156 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.62 
 
 
164 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  50.94 
 
 
164 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  49.04 
 
 
164 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  50.31 
 
 
164 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  49.69 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.2 
 
 
162 aa  151  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.29 
 
 
167 aa  151  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  48.39 
 
 
171 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.55 
 
 
183 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  53.89 
 
 
168 aa  150  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  54.49 
 
 
165 aa  150  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  48.6 
 
 
174 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.77 
 
 
200 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  45.86 
 
 
181 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.7 
 
 
171 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  54.43 
 
 
168 aa  149  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
181 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  50.32 
 
 
164 aa  147  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  49.03 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.75 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  57.79 
 
 
164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  45.86 
 
 
181 aa  145  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
180 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.32 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
181 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
181 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  48.68 
 
 
180 aa  141  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  48.45 
 
 
172 aa  141  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.37 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  44.37 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  44.51 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
183 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 
174 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  50 
 
 
182 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.14 
 
 
189 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.71 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.97 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  50.32 
 
 
166 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  50 
 
 
183 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
174 aa  135  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  50 
 
 
185 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  45.6 
 
 
284 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  44.39 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  45.6 
 
 
275 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.9 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  45.5 
 
 
186 aa  134  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  45.3 
 
 
180 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.99 
 
 
192 aa  134  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  50 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.78 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  46.2 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.06 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  50 
 
 
165 aa  132  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
173 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.39 
 
 
174 aa  132  3e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  45.11 
 
 
180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 
157 aa  131  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  44.69 
 
 
173 aa  130  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  45.11 
 
 
180 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  45.11 
 
 
180 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  44.51 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.13 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  49.04 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  44.69 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.86 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.96 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  44.57 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  47.59 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  45.86 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  41.51 
 
 
157 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  45.91 
 
 
182 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>