More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3343 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 180 aa  358  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  99.44 
 
 		 180 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 180 aa  323  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 180 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 180 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 275 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 284 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 180 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  87.78 
 
 		 180 aa  322  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  87.22 
 
 		 180 aa  320  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  86.11 
 
 		 180 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  92.78 
 
 		 180 aa  315  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  85 
 
 		 180 aa  314  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  85 
 
 		 180 aa  314  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  85 
 
 		 180 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  83.33 
 
 		 180 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  81.97 
 
 		 183 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  80.23 
 
 		 183 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  74.03 
 
 		 181 aa  275  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  72.38 
 
 		 181 aa  271  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  72.38 
 
 		 181 aa  271  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  72.38 
 
 		 181 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  71.82 
 
 		 181 aa  265  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  62.01 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  60.54 
 
 		 180 aa  216  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  64.85 
 
 		 182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  63.95 
 
 		 182 aa  214  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  57.61 
 
 		 186 aa  210  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  57.07 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  64.07 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  64.2 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  57.22 
 
 		 182 aa  200  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  55.87 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  64.44 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  61.44 
 
 		 172 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  56.11 
 
 		 182 aa  197  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  59.49 
 
 		 182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  60.25 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  62.57 
 
 		 171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 		 168 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  52.38 
 
 		 176 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.09 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  54.29 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  53.37 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  47.51 
 
 		 194 aa  171  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  47.51 
 
 		 194 aa  170  9e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.57 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  52.15 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  54.6 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  46.96 
 
 		 194 aa  166  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  54.66 
 
 		 173 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  57.24 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  50.88 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  52.98 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.29 
 
 		 133 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  50.29 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  54.6 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  54.6 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  51.16 
 
 		 174 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  54.6 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.53 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 		 173 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  53.99 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  55.28 
 
 		 173 aa  161  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  53.99 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  52.76 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  47.53 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.49 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  51.65 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  53.46 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  49.35 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  53.42 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  49.68 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.88 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  52 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  51.33 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  51.76 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  51.18 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.72 
 
 		 176 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.32 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  46.89 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  51.3 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  50.59 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  51.14 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  50.59 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>