More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0478 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  100 
 
 
180 aa  363  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 
164 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  54.61 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.29 
 
 
183 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  52.29 
 
 
171 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.74 
 
 
163 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  51.61 
 
 
176 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  52.7 
 
 
164 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  52.7 
 
 
164 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  50.67 
 
 
161 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
183 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
180 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 
173 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
183 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  52 
 
 
284 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  48.68 
 
 
181 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  52 
 
 
275 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
180 aa  148  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  52.26 
 
 
180 aa  147  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 
173 aa  147  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.3 
 
 
167 aa  147  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
180 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.02 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  43.98 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 
181 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 
181 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.4 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 
162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
173 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
173 aa  144  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 
168 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.35 
 
 
165 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 
181 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 
194 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  50.67 
 
 
180 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
194 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  39.38 
 
 
182 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
173 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
174 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  47.1 
 
 
183 aa  141  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.59 
 
 
164 aa  141  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
173 aa  141  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 
186 aa  141  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 
174 aa  141  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 
182 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 
166 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 
167 aa  141  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  48.72 
 
 
186 aa  140  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
182 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
173 aa  140  9e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.41 
 
 
173 aa  140  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.43 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.64 
 
 
179 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
174 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  50 
 
 
173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 
174 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
173 aa  137  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 
175 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.1 
 
 
166 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  45.18 
 
 
172 aa  137  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 
165 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.79 
 
 
158 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  48.72 
 
 
173 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.7 
 
 
176 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 
182 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  48.21 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  49.34 
 
 
182 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
164 aa  134  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  47.79 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.72 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 
184 aa  132  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.03 
 
 
167 aa  131  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 
160 aa  131  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.67 
 
 
175 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>