More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1747 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  61.96 
 
 		 173 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  57.86 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 197 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  53.57 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  58.79 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  43.98 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44.03 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 		 173 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.81 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.37 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.12 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  44.79 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.91 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  49.26 
 
 		 189 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  45.4 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.81 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  44.72 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  49.06 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.71 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.38 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.45 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 180 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 		 173 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44 
 
 		 187 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  44.91 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.75 
 
 		 182 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  50.39 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  43.59 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.33 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  45 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  44 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.59 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 182 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  36.94 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  48 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.51 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  42.31 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>