More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0476 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.89 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.26 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.03 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.84 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.91 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.6 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.83 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  37.57 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.13 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  36.17 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.36 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  45.29 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.58 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  44.85 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.83 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.67 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  34.43 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.64 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 174 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  43.64 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  42.77 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 		 170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.19 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  33.86 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 166 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  32.28 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  45.26 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2017  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.87 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.27 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.85 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.14 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.52 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 		 165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 156 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  44.59 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.27 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  43.7 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  48.15 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  48.15 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  48.15 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.18 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  36 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  37.29 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  45.93 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  42.6 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.65 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.93 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 		 158 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.15 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  37.33 
 
 		 165 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  43.7 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>