More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2188 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  62 
 
 
173 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.25 
 
 
173 aa  191  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.67 
 
 
173 aa  191  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  60 
 
 
173 aa  188  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  57.56 
 
 
175 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  58.94 
 
 
173 aa  184  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  60 
 
 
174 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  60 
 
 
174 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  54.39 
 
 
174 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  52.05 
 
 
173 aa  178  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  58.71 
 
 
174 aa  177  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  58.17 
 
 
173 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.19 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.76 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  53.8 
 
 
173 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  62 
 
 
173 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
173 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.13 
 
 
175 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
173 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
173 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
173 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  54.97 
 
 
173 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  58.17 
 
 
173 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  58.17 
 
 
173 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  56.14 
 
 
173 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  58.17 
 
 
173 aa  167  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  53.8 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  58.82 
 
 
173 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 
173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  60.39 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  52.94 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  49.71 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 
164 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  50.57 
 
 
180 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  58.06 
 
 
174 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 
181 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  58.06 
 
 
174 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  53.29 
 
 
164 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  58.06 
 
 
174 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
180 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  48.04 
 
 
204 aa  159  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
180 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  52.8 
 
 
164 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  52 
 
 
180 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  56.86 
 
 
173 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  52.23 
 
 
174 aa  157  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
180 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  59.73 
 
 
173 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  54.55 
 
 
176 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  56.77 
 
 
174 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  54.3 
 
 
164 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  56.13 
 
 
174 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  58 
 
 
173 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  57.62 
 
 
173 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  57.33 
 
 
173 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  50.87 
 
 
180 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  48.43 
 
 
171 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  56.67 
 
 
189 aa  152  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  48.72 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.49 
 
 
174 aa  151  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  47.7 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  47.7 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  47.7 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  47.7 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  47.7 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
173 aa  150  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  47.16 
 
 
275 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  47.16 
 
 
284 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  56.38 
 
 
173 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  47.7 
 
 
180 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  56.38 
 
 
173 aa  149  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  56.38 
 
 
173 aa  149  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.14 
 
 
175 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  54.55 
 
 
179 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.55 
 
 
172 aa  147  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  45.4 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01729  Holliday junction resolvase  60.17 
 
 
146 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000012224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  45.4 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  45.99 
 
 
194 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  50.3 
 
 
174 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
194 aa  144  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  48.67 
 
 
180 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>