More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3202 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  76.4 
 
 		 166 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  70.62 
 
 		 166 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  63.19 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  56.88 
 
 		 170 aa  186  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  53.59 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.88 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.79 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.59 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.86 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.42 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.34 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  41.94 
 
 		 180 aa  121  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  49.61 
 
 		 168 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.77 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  46.36 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.14 
 
 		 172 aa  118  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 		 164 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 173 aa  118  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.56 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.79 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.48 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  49.22 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  44.09 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  48.82 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 173 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.76 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.39 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.28 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 284 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 275 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  38.12 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  44.09 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 174 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  44.64 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 194 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  43.67 
 
 		 169 aa  111  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 173 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 182 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  44.22 
 
 		 173 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 184 aa  111  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  41.14 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  42.52 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.62 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  42.52 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  44.62 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.04 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  42.52 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  42.52 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  42.52 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>