More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2324 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  100 
 
 
166 aa  336  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  70.78 
 
 
197 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  67.3 
 
 
166 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  66.46 
 
 
173 aa  216  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  58.79 
 
 
170 aa  193  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 
173 aa  187  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  47.65 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  50.31 
 
 
176 aa  143  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  48.99 
 
 
173 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 
164 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  50 
 
 
164 aa  141  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  49.33 
 
 
164 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  49.33 
 
 
164 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 
165 aa  140  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 
173 aa  140  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
173 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
173 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
173 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
173 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.05 
 
 
173 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 
175 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  49.24 
 
 
173 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  49.24 
 
 
173 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  49.24 
 
 
173 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
173 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
189 aa  136  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  49.24 
 
 
173 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  49.24 
 
 
173 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
173 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.9 
 
 
173 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  48.41 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  44.22 
 
 
180 aa  135  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  47.73 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  47.97 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  47.97 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  47.97 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  47.97 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  44.22 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  45.58 
 
 
183 aa  133  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  46.36 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  47.97 
 
 
180 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 
275 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  47.3 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 
284 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
173 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 
173 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 
174 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  45.95 
 
 
183 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  45.95 
 
 
183 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 
191 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 
173 aa  130  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  45.16 
 
 
180 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  46.62 
 
 
180 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 
174 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.39 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  46.98 
 
 
173 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  45.33 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  51.23 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.54 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.74 
 
 
190 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 
181 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  50.39 
 
 
173 aa  129  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.14 
 
 
186 aa  127  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 
194 aa  127  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.75 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  52.67 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  45.34 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  48.37 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>