More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1433 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  56.69 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  57.32 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.94 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  51.25 
 
 		 162 aa  187  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  51.55 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.62 
 
 		 167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.97 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.27 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  51.63 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.63 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.86 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  45.96 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  47.24 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.93 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  48.15 
 
 		 171 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  48.41 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.21 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  46.01 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.33 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  52.6 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.06 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.81 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  42.94 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  50.98 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  45.96 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  44.58 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  43.14 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 180 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.38 
 
 		 167 aa  140  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  44.12 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.45 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  42.69 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  42.69 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 284 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  44.81 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.4 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  44.16 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  43.59 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.76 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  42.51 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  43.4 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.59 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.59 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  42.41 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.26 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  43.59 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  40.49 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.37 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  41.77 
 
 		 173 aa  127  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  46.67 
 
 		 189 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  43.59 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.14 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  42.04 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.83 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  38.36 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  42.5 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>