More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3491 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 173 aa  346  8e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  61.96 
 
 		 170 aa  211  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  56.6 
 
 		 166 aa  196  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  56.33 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3202  Holliday junction resolvase  54 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0673445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.14 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  41.92 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  43.23 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.01 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.56 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.83 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  43.12 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.77 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  45.06 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  43.87 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.88 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.16 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  43.95 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.74 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  43.23 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.29 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.85 
 
 		 186 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  41.51 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  40.26 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  46.09 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.58 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  40.96 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  42.31 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  41.77 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1794  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.098383  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  39.76 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.05 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.38 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.95 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.75 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  42.24 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  49.68 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  43.75 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.94 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.16 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.11 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  39.62 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.08 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  45.58 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>