More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1346 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  100 
 
 
166 aa  339  9e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  79.62 
 
 
162 aa  270  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  64.71 
 
 
159 aa  217  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  60.61 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.56 
 
 
165 aa  209  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.04 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.82 
 
 
163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  58.67 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  54.55 
 
 
165 aa  195  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.13 
 
 
164 aa  193  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  51.59 
 
 
161 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.59 
 
 
167 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.17 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  49.09 
 
 
164 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  48.48 
 
 
164 aa  168  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  49.69 
 
 
171 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  50.61 
 
 
172 aa  166  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  47.27 
 
 
164 aa  163  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.67 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  55.41 
 
 
168 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  52.47 
 
 
168 aa  157  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 
164 aa  157  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.43 
 
 
171 aa  156  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 
156 aa  156  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  53.64 
 
 
164 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.41 
 
 
200 aa  154  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.58 
 
 
164 aa  154  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  47.2 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 
165 aa  154  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 
158 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 
164 aa  149  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.88 
 
 
167 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.95 
 
 
176 aa  148  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  51.33 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.8 
 
 
184 aa  143  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.39 
 
 
166 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  49.36 
 
 
163 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.68 
 
 
192 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  42.21 
 
 
180 aa  141  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  44.52 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 
173 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.3 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.52 
 
 
173 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 
181 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  44.23 
 
 
180 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 
173 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  42.33 
 
 
181 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.87 
 
 
165 aa  134  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 
181 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 
181 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  44.87 
 
 
165 aa  134  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 
181 aa  133  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 
173 aa  133  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.23 
 
 
173 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  42.33 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.33 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.07 
 
 
178 aa  132  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.2 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.49 
 
 
183 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.67 
 
 
202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.74 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.51 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 
180 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.31 
 
 
167 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.75 
 
 
192 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 
182 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 
156 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.14 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  41.1 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  44.85 
 
 
173 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  38.65 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  38.65 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  38.65 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 
275 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 
284 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.5 
 
 
158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 
175 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 
182 aa  125  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  45.59 
 
 
173 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>