More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0892 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 172 aa  354  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  52.03 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  53.06 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  51.95 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.74 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  53.74 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  53.38 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  54.42 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  52.38 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  52.03 
 
 		 180 aa  148  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 		 164 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  47.09 
 
 		 181 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  47.95 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  47.95 
 
 		 180 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  51.35 
 
 		 180 aa  147  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  51.02 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  55.03 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  50.68 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  50.68 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.34 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  46.51 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  47.67 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.55 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.34 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  50.34 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 184 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  55.7 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  50.68 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  49.33 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  48.99 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  48.32 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  55.1 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  47.65 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  55.1 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 284 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  47.65 
 
 		 181 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  46.78 
 
 		 275 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  50.68 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  50.68 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  54.42 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  53.74 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  53.06 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  53.06 
 
 		 173 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  53.06 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  53.06 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  54.05 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.36 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  53.74 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  47.65 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  51.7 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  48.32 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  52.03 
 
 		 179 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  46.39 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  50.67 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  54.42 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.06 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  49.7 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 167 aa  135  4e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  49.7 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  49.7 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  51.49 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  51.49 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  51.49 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  51.49 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2052  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2057  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0681914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  46.39 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.45 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2112  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0214105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1225  Holliday junction resolvase  52.24 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.177509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  51.02 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  51.02 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  51.02 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>