More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1614 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  100 
 
 
158 aa  320  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.81 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.67 
 
 
165 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  51.66 
 
 
164 aa  155  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
182 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 
166 aa  152  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
162 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  46.5 
 
 
159 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.31 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  46.79 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
165 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.71 
 
 
167 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.37 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.61 
 
 
164 aa  136  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.88 
 
 
160 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 
162 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.71 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 
156 aa  130  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 
164 aa  127  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  43.79 
 
 
172 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.04 
 
 
200 aa  124  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.38 
 
 
165 aa  124  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  42.38 
 
 
165 aa  123  9e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  44.29 
 
 
157 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 
167 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 
165 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
168 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.67 
 
 
165 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.85 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.68 
 
 
192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.71 
 
 
192 aa  114  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.03 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 
183 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  37.75 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.3 
 
 
171 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.71 
 
 
166 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  36.03 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  35.71 
 
 
173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  33.54 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  36.03 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.42 
 
 
190 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  35.62 
 
 
180 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.41 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.69 
 
 
167 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 
162 aa  105  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 
165 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.67 
 
 
191 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  33.77 
 
 
180 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  31.21 
 
 
170 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.16 
 
 
189 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 
182 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.12 
 
 
191 aa  103  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 
182 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  41.13 
 
 
163 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.42 
 
 
172 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  30.26 
 
 
181 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 
194 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 
175 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  33.58 
 
 
167 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  32.47 
 
 
200 aa  101  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.81 
 
 
330 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 
174 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
181 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0327  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 
168 aa  101  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00145827  hitchhiker  0.00759583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
284 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
275 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 
174 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 
174 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  32.68 
 
 
173 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 
183 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 
183 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  32.7 
 
 
166 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  34.62 
 
 
181 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 
180 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  37.24 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 
180 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  33.97 
 
 
181 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.21 
 
 
187 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  33.97 
 
 
181 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  40 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  40 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 
187 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>