More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1582 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  88.95 
 
 		 172 aa  306  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  65.13 
 
 		 181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  65.13 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  60.87 
 
 		 180 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  63.82 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  62.34 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  62.34 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  61.69 
 
 		 182 aa  191  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  60.76 
 
 		 186 aa  191  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 		 186 aa  190  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  61.59 
 
 		 183 aa  190  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 180 aa  190  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  61.59 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  59.01 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  63.06 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 275 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  59.75 
 
 		 284 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  59.12 
 
 		 180 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  57.76 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 		 180 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  61.84 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  61.84 
 
 		 181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  56.96 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  58.28 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  59.48 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  58.13 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  58.94 
 
 		 183 aa  174  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  56.49 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  56.49 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  56.86 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2214  Holliday junction resolvase  65.15 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0307344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  61.07 
 
 		 179 aa  161  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  51.53 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  51.23 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  51.66 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  50.65 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  50.66 
 
 		 176 aa  143  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  48.75 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  47.83 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0060  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.32 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  48.43 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.91 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  53.55 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.15 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  51.01 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  47.8 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  48.65 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.03 
 
 		 158 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  44.83 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  47.97 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 182 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  47.4 
 
 		 168 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  50.68 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2721  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.63 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  50.33 
 
 		 173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  50.99 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  50.93 
 
 		 179 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.33 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.75 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  51.52 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  47.71 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 		 167 aa  131  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  51.52 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  49.01 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 173 aa  131  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  48.34 
 
 		 173 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  45.16 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.06 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  50.76 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.52 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  50.76 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  50.76 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  50.76 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>