More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2303 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 192 aa  377  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  95.03 
 
 		 192 aa  324  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  62.63 
 
 		 189 aa  201  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.49 
 
 		 199 aa  184  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.2 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  61.96 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.51 
 
 		 170 aa  177  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  54.79 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  59.79 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  57.14 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  56.54 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.6 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.13 
 
 		 176 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  58.02 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.74 
 
 		 330 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.4 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  65.38 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.21 
 
 		 193 aa  160  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.71 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  57.69 
 
 		 194 aa  157  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.15 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  60.13 
 
 		 175 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.54 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  56 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  56 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  56 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  51.6 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  51.22 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  57.69 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  54.15 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.06 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  56.5 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.97 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 172 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  56.76 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  55.76 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.49 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  39.35 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 164 aa  117  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.75 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  38.73 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.13 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  33.76 
 
 		 157 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 165 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  40.65 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.75 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.33 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 173 aa  104  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  31.41 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.18 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.86 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  37.37 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  34.13 
 
 		 181 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  40.24 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  32.05 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  41.94 
 
 		 168 aa  101  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.05 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  40.12 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  36.84 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  30.77 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  32.68 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  33.55 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  38.3 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  36.32 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  39.01 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  34.13 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  37.77 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 167 aa  98.6  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  36.32 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  36.32 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.97 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  34.13 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 183 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.77 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.37 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.51 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  35.79 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  35.79 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  34.74 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>