More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0079 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  81.01 
 
 		 184 aa  304  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  75.42 
 
 		 184 aa  291  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.44 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  57.22 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  57.3 
 
 		 189 aa  217  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.43 
 
 		 182 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.31 
 
 		 202 aa  205  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  55.25 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.72 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.51 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.04 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.41 
 
 		 191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.28 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  42.28 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.61 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 192 aa  127  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.58 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.43 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.06 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.28 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.08 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.15 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.43 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.88 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.67 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  34.16 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  38 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  40.51 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  39.49 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  35.88 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  34.67 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.31 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2032  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00302461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.11 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  39.05 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2017  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.83 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0529  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  39.39 
 
 		 179 aa  104  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.67 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.53 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  36.24 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0987  Holliday junction resolvase  32.67 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.74 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  36.03 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  30.26 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  36.49 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  37.04 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  34.84 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.33 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>