More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1369 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  86.23 
 
 		 178 aa  227  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  66.67 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  65.43 
 
 		 182 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.64 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  66.67 
 
 		 207 aa  187  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.85 
 
 		 330 aa  187  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  58.14 
 
 		 188 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.9 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  72.61 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  61.49 
 
 		 194 aa  183  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  61.82 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  64.15 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  60.95 
 
 		 199 aa  180  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.81 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.26 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.45 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.62 
 
 		 185 aa  173  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.52 
 
 		 190 aa  171  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 		 220 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  66.46 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  61.15 
 
 		 197 aa  163  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  56.21 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  70.51 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.58 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.24 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60 
 
 		 215 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  62.82 
 
 		 175 aa  154  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  49.35 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  55.62 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.99 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.03 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  59.29 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  52.26 
 
 		 194 aa  133  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.81 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.58 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  59.09 
 
 		 211 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.24 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.1 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.51 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.16 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  43.11 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  44.03 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  43.11 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  44.03 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  43.11 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  42.51 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  42.51 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.73 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  41.18 
 
 		 180 aa  114  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.37 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  41.46 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.92 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  31.85 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.61 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.35 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.32 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.32 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.32 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.32 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  41.32 
 
 		 284 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  41.32 
 
 		 275 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.72 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.61 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.92 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  40.12 
 
 		 180 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.33 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  34.84 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  42.01 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0992  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.39 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0391793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.35 
 
 		 191 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  38.82 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1854  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>