More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5146 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 178 aa  341  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  86.23 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  66.86 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  66.05 
 
 		 182 aa  198  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.85 
 
 		 170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  62.05 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  63.91 
 
 		 199 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.27 
 
 		 330 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  69.51 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  62.73 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  64.29 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.9 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  63.37 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  73.25 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.7 
 
 		 188 aa  183  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.73 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.03 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.26 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.81 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  60.25 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  67.48 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  57.63 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.21 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  68.15 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  56.5 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 		 193 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 		 193 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 		 193 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  61.15 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.11 
 
 		 215 aa  161  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  65.38 
 
 		 175 aa  160  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.87 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  62.14 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.05 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  58.97 
 
 		 208 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.97 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  48.05 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  41.36 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.22 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.79 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.1 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.45 
 
 		 165 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.45 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  41.98 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  59.09 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 180 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 180 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  42.26 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.97 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  43.4 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  42.48 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  42.26 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.76 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  41.67 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.1 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.07 
 
 		 180 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  40.59 
 
 		 173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  40.49 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 284 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  40.48 
 
 		 275 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.32 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.88 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  41.67 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  42.26 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  42.26 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>