More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1692 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 330 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  79.25 
 
 		 196 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  64.17 
 
 		 188 aa  219  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  70.81 
 
 		 194 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  71.71 
 
 		 193 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  71.71 
 
 		 193 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  71.71 
 
 		 193 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.14 
 
 		 189 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  74.07 
 
 		 181 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  71.43 
 
 		 220 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  60.75 
 
 		 215 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  62.36 
 
 		 182 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  66.45 
 
 		 189 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.1 
 
 		 170 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  60.71 
 
 		 200 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.45 
 
 		 188 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.79 
 
 		 185 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  57.06 
 
 		 177 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  65.85 
 
 		 207 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  65.38 
 
 		 192 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  64.74 
 
 		 192 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.52 
 
 		 190 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  67.27 
 
 		 178 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.87 
 
 		 199 aa  170  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  61.44 
 
 		 199 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.74 
 
 		 176 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  64.85 
 
 		 172 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  63.47 
 
 		 178 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  59.24 
 
 		 197 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  64.29 
 
 		 193 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  63.12 
 
 		 175 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.45 
 
 		 176 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.19 
 
 		 193 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  58.02 
 
 		 208 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  60.96 
 
 		 160 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.45 
 
 		 188 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 		 156 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.05 
 
 		 167 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 194 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 		 164 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.37 
 
 		 160 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  39.51 
 
 		 161 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  42.59 
 
 		 165 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.89 
 
 		 164 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.11 
 
 		 172 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.24 
 
 		 163 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45 
 
 		 164 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 158 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  40.85 
 
 		 182 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 166 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 		 164 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 		 165 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36.02 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  47.02 
 
 		 183 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.04 
 
 		 162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.67 
 
 		 179 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  46.58 
 
 		 168 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  56 
 
 		 211 aa  109  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.73 
 
 		 164 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.78 
 
 		 189 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  42.94 
 
 		 168 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 181 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 173 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  38.79 
 
 		 164 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 180 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 173 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 180 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 166 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 181 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  32.03 
 
 		 157 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 183 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  40.44 
 
 		 180 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  39.63 
 
 		 165 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 183 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.61 
 
 		 164 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 181 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 157 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  41.08 
 
 		 180 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  38.56 
 
 		 180 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 173 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.95 
 
 		 164 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 180 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 192 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 180 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.39 
 
 		 191 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.73 
 
 		 184 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.67 
 
 		 173 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 		 181 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 180 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  41.08 
 
 		 180 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 166 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  41.08 
 
 		 180 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 173 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>