More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2352 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 170 aa  335  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  71.18 
 
 		 200 aa  227  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  70.83 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  68.24 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  71.15 
 
 		 185 aa  210  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.07 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.68 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  65.19 
 
 		 189 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  71.52 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.1 
 
 		 199 aa  187  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  72.44 
 
 		 176 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.1 
 
 		 330 aa  184  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  63.92 
 
 		 199 aa  183  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.05 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  67.66 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  63.41 
 
 		 207 aa  180  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  58.33 
 
 		 188 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.26 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  59.51 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  66.88 
 
 		 175 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  59.51 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  66.45 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  64.85 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  61.94 
 
 		 190 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  60 
 
 		 208 aa  168  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  63.27 
 
 		 160 aa  167  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  58.06 
 
 		 194 aa  167  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  60.9 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  63.64 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  57.14 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.18 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  57.05 
 
 		 193 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  57.05 
 
 		 193 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  57.05 
 
 		 193 aa  160  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  65.45 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.19 
 
 		 193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  56.13 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  58.82 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.54 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.74 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.79 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  42.17 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.97 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  43.31 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  37.43 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.74 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.26 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.04 
 
 		 192 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.18 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.38 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  43.42 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.24 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.42 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  43.1 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.33 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  43.9 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  43.37 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  43.37 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.32 
 
 		 184 aa  110  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 275 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  42.53 
 
 		 284 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.24 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  42.37 
 
 		 183 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  42.37 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  41.95 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  42.77 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.27 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 180 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>