More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11371 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  100 
 
 
158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  73.38 
 
 
154 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  68.83 
 
 
154 aa  207  5e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  70.07 
 
 
154 aa  202  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  57.79 
 
 
157 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
157 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  59.06 
 
 
157 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  57.72 
 
 
157 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  62.5 
 
 
154 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  63.16 
 
 
154 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  51.9 
 
 
163 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  48.63 
 
 
163 aa  140  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 
157 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.59 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.94 
 
 
161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
164 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.28 
 
 
165 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  49.03 
 
 
161 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.51 
 
 
157 aa  115  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 
165 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  41.84 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 
168 aa  110  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  33.96 
 
 
182 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.31 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 
169 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.24 
 
 
192 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.27 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.71 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.58 
 
 
163 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  32.91 
 
 
162 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.55 
 
 
172 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 
163 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.48 
 
 
164 aa  103  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.91 
 
 
191 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.24 
 
 
190 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.54 
 
 
179 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 
165 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 
192 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.67 
 
 
202 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 
164 aa  100  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 
192 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  36.23 
 
 
168 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  37.59 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.22 
 
 
178 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.24 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.44 
 
 
200 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.56 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.21 
 
 
187 aa  97.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 
181 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 
181 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.17 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  36.24 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  35.03 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 
173 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  36.94 
 
 
183 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  30.13 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 
158 aa  94.4  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  36.88 
 
 
164 aa  94  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.17 
 
 
192 aa  93.6  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.03 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.43 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.88 
 
 
200 aa  92.4  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  33.12 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.26 
 
 
176 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.86 
 
 
170 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 
174 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.07 
 
 
172 aa  91.7  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  34.75 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.41 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  34.23 
 
 
181 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 
180 aa  90.5  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1897  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  29.75 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  34.87 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  34.16 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 
174 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2057  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  31.85 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.26 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  31.58 
 
 
181 aa  88.6  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.75 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  34.67 
 
 
181 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  30.13 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  36.25 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0026  Holliday junction resolvase  33.55 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580095  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2444  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.1 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  36.25 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>