231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0461 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  39.26 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  38.98 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  38.37 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  36.07 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  36.07 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  34.93 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  39.42 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  38.59 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  34.02 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  32.79 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  34.12 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.25 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  36.44 
 
 		 248 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  32.79 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  33.2 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  31.97 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  32.66 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  35.92 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  34.94 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  34.31 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  33.58 
 
 		 293 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.57 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.48 
 
 		 293 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.01 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  32.95 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  35.04 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  34.32 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  40.61 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  34.32 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  34.23 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  35.38 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  33.33 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  32.95 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  32.56 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  32.56 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.37 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  32.06 
 
 		 270 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  34.31 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.53 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  31.23 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  31.23 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  31.23 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  31.23 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  31.23 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  32.34 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.76 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  34.17 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  30.83 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  33.46 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  31.02 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  34.17 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  37.82 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.74 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  28.46 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  27.89 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  33.08 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.02 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  32.04 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.88 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  33.47 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  28.84 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  32.08 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  30.13 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  26.46 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  30.06 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  26.24 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  29.71 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  24.47 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  36.02 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  34 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  26.56 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  32.24 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  24.55 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  31.67 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  31.8 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  27.16 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  30.65 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  27.31 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.52 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.89 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  32.67 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  29.93 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  34.4 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  34 
 
 		 242 aa  62  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02601  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 251 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  28.04 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.71 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  29.2 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  28.42 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  33.12 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  29.41 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  28.38 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  34.78 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>