233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1968 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  72.86 
 
 		 269 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  32.77 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  32.77 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  33.08 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.6 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  33.09 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  32.13 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  35.32 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  32.26 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  33.62 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  31.48 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  31.06 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  30 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  30.55 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  31.48 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  32.1 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  31.48 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  32.3 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  30.94 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  31.13 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  32.08 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  32.08 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  32.56 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  31.02 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  30.56 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  29.67 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  30.88 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  30.88 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  29.15 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  30.88 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  28 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 248 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  34.64 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.35 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  32.03 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  29.43 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  30 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  32.02 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  26.19 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  29.06 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  27.24 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  32.87 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  27.1 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  30.33 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  28.97 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  30.12 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  28.16 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  28.14 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.79 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  36.96 
 
 		 260 aa  72  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  32.85 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  26.88 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  31.88 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.04 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  35.88 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  30 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  34.59 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  33.83 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  32.61 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.61 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  30.64 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  25.3 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23250  transcriptional activator, putative, Baf family  26.55 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.61 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.37 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  33.57 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.51 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  29.38 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  42.59 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  29.38 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  29.38 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  32.84 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  25.21 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  30.11 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  37.33 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  25.3 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.43 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  24.7 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>