253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04225 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  43.8 
 
 
244 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  44.67 
 
 
254 aa  199  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  41.32 
 
 
240 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  39.83 
 
 
235 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  38.78 
 
 
251 aa  165  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.57 
 
 
268 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  36.14 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1518  pantothenate kinase  27.67 
 
 
260 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1765  pantothenate kinase  29.53 
 
 
272 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  28.63 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  30.38 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  25.38 
 
 
270 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.06 
 
 
263 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  29.5 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  29.08 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.25 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  24.31 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.85 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  29.69 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  28.74 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  26.96 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  29.8 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  26.72 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  25.19 
 
 
275 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  28.63 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  29.96 
 
 
262 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  29.57 
 
 
262 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.82 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  30.2 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  29.57 
 
 
262 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  31.82 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  36.94 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.28 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  27.91 
 
 
254 aa  92  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  27.06 
 
 
259 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  29.3 
 
 
255 aa  92  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.52 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1724  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.9 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.345789  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.35 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  28.88 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  28.88 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.69 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  29.06 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  28.74 
 
 
255 aa  89  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.33 
 
 
252 aa  89  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  27.92 
 
 
264 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  30.42 
 
 
254 aa  88.6  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.16 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  28.95 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  30.42 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  28.09 
 
 
264 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  29.92 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  30.88 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  28.57 
 
 
258 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000107258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  26.15 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  27.34 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  28.24 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  27.78 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  27.78 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  25.59 
 
 
262 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  28.85 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  27.63 
 
 
258 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  33.21 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  26.79 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  27.2 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  25 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  27.59 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  26.74 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  24.91 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  24.12 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  30.77 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  28.15 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  28.35 
 
 
270 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.03 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  27.8 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  22.93 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  26.8 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  27.41 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2865  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.12 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  27.41 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  25.1 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.44 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  22.96 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5146  pantothenate kinase  25.37 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  25.37 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.52 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4846  pantothenate kinase  25.37 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  27.09 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  25.56 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  30.32 
 
 
263 aa  79  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  27.24 
 
 
269 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  22.52 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>