82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02601 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_02601  transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00891  transcriptional regulator  51.8 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.529002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01451  transcriptional regulator  39.67 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1444  accessory factor Bvg  41.85 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.327883  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2308  putative transcriptional regulators  51 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0385  putative transcriptional acitvator, Baf  45.85 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.520442  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  34.23 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00901  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66751  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  32.14 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4022  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.98 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000147612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  30.67 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1801  pantothenate kinase  31.28 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  28.63 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  36.36 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  37.18 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  26.63 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  30.74 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  30.35 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  30.89 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.15 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  35.15 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  34.97 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.13 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  35.15 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  35.24 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  35.15 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  33.73 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  35.24 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  34.29 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  35.19 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  35.14 
 
 		 254 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  28.98 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  30.82 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  30.82 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  30.19 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  33.94 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.32 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  33.94 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  27.61 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  27.34 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0578  putative transcriptional acitvator, Baf family  22.7 
 
 		 257 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  26.77 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  32.72 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.94 
 
 		 293 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.21 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.53 
 
 		 295 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  34.91 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  26.77 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  31.68 
 
 		 293 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  32.93 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30.57 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  23.76 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  26.92 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  31.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  34.84 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3272  pantothenate kinase  28.67 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  27.06 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  30.36 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  28.93 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  32.47 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  24.83 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  25 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  24.83 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  31.82 
 
 		 249 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  24.51 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  27.62 
 
 		 257 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  27.74 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  30.82 
 
 		 266 aa  42  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  29.68 
 
 		 250 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>