253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0189 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  100 
 
 		 266 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  35.71 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  36.33 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  32.68 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  33.97 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  33.59 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  34.22 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  35.1 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  29.69 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  32.81 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  33.2 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  33.2 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  29.18 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  28.06 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  28.74 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.67 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  32.81 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  30.43 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  27.84 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  31.82 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  30.5 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  30.15 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  29 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  28.83 
 
 		 289 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  28.79 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  30.3 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  32.28 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  32.81 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  32.27 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  32.27 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  32.68 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.86 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  30.04 
 
 		 254 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  31.56 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  29.66 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  31.35 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  32.71 
 
 		 254 aa  96.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  30.32 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  29.39 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  32.18 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  31.05 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.53 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.52 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.67 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  29.03 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.86 
 
 		 242 aa  89.7  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  29.41 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  28.47 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  29.3 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0835  pantothenate kinase  32.95 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  28.45 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0452  pantothenate kinase  32.22 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  35.67 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  31.1 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  26.88 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  25.97 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000188548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  31.1 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  30.18 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  27.5 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.12 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  27.41 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  25.2 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  25.19 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  26.62 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  31.67 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  28.39 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  28.39 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  26.94 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.27 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  31.09 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0535  pantothenate kinase  26.51 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0719768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  27.72 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.69 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.32 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  27.4 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1408  pantothenate kinase  28.35 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  29.1 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.07 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  27.35 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  29.06 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  28.35 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  28.06 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>